pooneilの脳科学論文コメント

■ Nature 7/29

"Neurons compute internal models of the physical laws of motion."
Vestibular nucleiと小脳のrostral fastigial nucleusからの記録で慣性などの物理法則を内部モデル化している証拠を提出。
Vestibular系ってはずかしながら私なんにも知らないんですよね。VOR (vestibulo-ocular reflex)とかとくに重要であるにもかかわらず。というわけでこれまでNature and Scienceで関わってるっぽいもの。

• Science '00 "Evidence for Brainstem Structures Participating in Oculomotor Integration."
• Nature '98 "Common reference frame for neural coding of translational and rotational optic flow."
• Nature '95 "Modulation of conscious experience by peripheral sensory stimuli."

■ Science AOP

"Distinct Ensemble Codes in Hippocampal Areas CA3 and CA1." Edvard I. Moser。
先週のNature（"Comparison of population coherence of place cells in hippocampal subfields CA1 and CA3."）へのコメンタリかと思ったら違うようです。"We examined the function of this structural differentiation ..."なんて書いてある。CA3-CA1のfunctionのdissociationを出すのに競走をしていたようですな。しかも微妙にずれた出版日。Natureの方はreceive 1/8、accept 6/10で online publicationが 6/30、Scienceの方はsubmit 5/13、accept 7/8でonline publicationが 7/22、というわけでNatureの方が早かったけど、（その情報を察知してか、）Scienceのほうが追い上げたということらしい。Journal clubで採り上げる人はこの二つをセットにしてプレゼンしないと、あっちの方はどうなのと問い詰められること必至ですな、これは。
内容については紙で出版されてからにします。ていうかうちではAOPのpdf取れないんですよね。
Edvard I. Moserといえば私にとってはScience '98 "Impaired Spatial Learning after Saturation of Long-Term Potentiation."です。Barnes and McNaughtonの"Recovery of spatial learning deficits after decay of electrically induced synaptic enhancement in the hippocampus."みたいな、LTPを海馬全体に惹き起こしてやると空間学習がimpairされるというやつでした。なんかすげ―感心した憶えがあるのだけれど、どの点だったか思い出せない。SFNでこの内容を見たときは夫婦並んでポスターで、そろって美男美女だった印象がある、どうでもいいことだが。
Science '02 "Place Cells and Place Recognition Maintained by Direct Entorhinal-Hippocampal Circuitry."のほうはCA3 -> CA1の入力を取り除いてentorhinal cortex -> CA1の入力だけで何ができるか、という議論だから、今回のCA1-CA3のfunctional dissociationへ向かうのは当然の流れだったと言えましょう。

■ 伝染するあくび("contagious yawning") つづき。

7/27のCorreggioさんへの返答から膨らませてみました。
Cognitive Brain Research '03 "Contagious yawning: the role of self-awareness and mental state attribution."(pdf)についてまとめます。
被験者にヴィデオであくびをしている人の映像を見てもらって、あくびをするかどうか数えます。この数（=あくびが伝染しやすいかどうか）とさまざまな心理テストとの相関を調べてやるわけです。
まず、自己意識の障害についてのテストであるSPQテストのスコア(自己意識に障害があるとこのスコアが上がります)と伝染したあくびの数は反比例します。つまり、自己意識をしっかり持っている人ほどあくびが伝染しやすいのです。
また、自分の顔を見つけ出すテストでも、このスコアが高い（自己意識を持っている）人ほどあくびが伝染しやすい。
それから、「心の理論」研究で使われるお話を聞いてその中に含まれるfalse belief（だれがなにを勘違いしているか）およびsocial faux pas（だれがどんな良くないことをしているか）を報告するテストをすると、social faux pasのほうのみcontagious yawningの数と相関があるというのです。著者はこのことから、他者の立場に立って考える能力がcontagious yawningに関わる、とします。（ここはなんかデータが汚いわけですな。）
ところでこの論文、被験者が普段からどのくらいあくびをするかについては記載がないのではないでしょうか。そうしたら、あくびが伝染しやすいのか、ちょっとしたきっかけですぐにあくびが出やすいのかわからないのだけれど。ほかの論文でも、コントロールとしてヴィデオの中で微笑む人をみて何回微笑むか（当然ゼロ）というのを出しているのを見たことがあるけれど、そうではなくて、コントロールとは、退屈なビデオを見ているうちに何回あくびをするか、ではないでしょうか。このへんどうしてるんだろ。
というわけで7/27のCorreggioさんへの返答につなげると、Imitationとcontagious yawningとはミラーニューロンシステムを共有している一方で、幼児のimitationにはまだ自他の分離(self-awareness)と他者の顔色をうかがうような社会性(心の理論を必要とするようなmental-state attribution)とが欠けていて(Cognitive Brain Research ’03)、それらがあってはじめてcontagious yawningのように高度な認知的行動が起こる、ということのようですね。そしてもちろん、ミラーニューロンシステムとはたぶん、ただのimitationにのみ関わるのではなくて、そのようなimitationを通して心の理論と共感とを獲得していくダイナミックな過程に関わっている、ということになるのでありましょう（Rizzolattiは読んでないけど、こういうことを言っているのではないですか）。

■ Empathy

せっかくなのでempathy、ミラーニューロンあたりで検索して関連論文漁ってみました。

• PNAS '03 "Neural mechanisms of empathy in humans: A relay from neural systems for imitation to limbic areas." Premotorやsuperior parietalだけでなく、insulaやamygdalaで差分が出る、というのがミソのよう。
• "The manifold nature of interpersonal relations: the quest for a common mechanism." Vittorio Gallese。"EARLY AND MATURE IMITATION"なんてセクションもある。
• "What imitation tells us about social cognition: a rapprochement between developmental psychology and cognitive neuroscience." アブストにこんなこと書いてある。"We marshal evidence that imitation recruits not only shared neural representations between the self and the other but also cortical regions in the parietal cortex that are crucial for distinguishing between the perspective of self and other."
• "Empathy for Pain Involves the Affective but not Sensory Components of Pain." Raymond J. DolanとChris D. Frith。2/25にChris Frithがまたらしい感じ(empathy)を扱っている、とだけ書きましたが、これがCorreggioさんの言及したFrithのfMRIですね。"their loved one"ってすごいなあ。でも痛みへのempathyだったら、自分の子供を使った方が強烈だと思う、って何を考えているんだ。
• "Both of Us Disgusted in My Insula: The Common Neural Basis of Seeing and Feeling Disgust." Giacomo Rizzolatti

(追記：リストを独立したエントリーとして独立させました。Correggioさんご指摘の論文を追加しました。)

■ Nature Neuroscience 8月号

• "A morphological basis for orientation tuning in primary visual cortex." David Fitzpatrick。図だけしか見ていないけどこれすごいな。V1のlayer 2/3ニューロンのorientation selectivityがどうやってできるかを入力線維の走行パターンによって説明しようとするんだけれど、News and Views ("A shrewd insight for vision." Martin Usrey)のFigure 1にあるように、それがlayer 4からlayer 2/3への投射がねじれていることによって実現されている（分かりにくいから図を見てください）、ということを示したというのです。これはおどろき。普通そういったorientation selectivityは層を垂直に延びるaxonがdivergentに投射していること（そのときには今回のようなasynmetricalな構造は想定されていない）および層に平行な方向のlateralなconnectionとによって実現されるものだと思われていたわけですから。このことはV1のpyramidalニューロンが垂直方向に延びているとするコラム仮説の修正を要請するものだし、0-180degreeの方位を表象する領域がハイパーカラム的な構造をしていることを予言します。 また、これは重要なことだと思うのですが、V1の (optical iamgingで作る）orientation mapでのpinwheel center構造（NVのFigure.1での黄、緑、青、紫、赤に囲まれた領域。orientation selectivity map上での鞍点のようなもの。これもFitzpatrickやBohnhofferとかが明らかにしてきたもののはずですが）について、今回の論文で出てきたような構造（layer 4での回転する軸の中心に対応する部分がlayer 2/3でpinwheel centerになっていると考えればわかりやすい*1）から説明することもできます。 これまでの論文とどうconsistentなのかも気になるけれど、V1の局所回路についてずっとやってきたFitzpatrickに言われるのでは何もいえなくなってしまいます。
• "Prediction of immediate and future rewards differentially recruits cortico-basal ganglia loops." 7/3のコメント欄でmmmmさんが言及した、銅谷先生のところでのfMRIの論文。
• "Underlying principles of visual shape selectivity in posterior inferotemporal cortex."

*1：いや、中心が対応するという言い方も正確でないか。点と点との一対一対応にはないわけだから。なんにしろ、すぐにモデルが作れそう。

■ Kinksを歌って泣く。

自分で歌って自分で泣くのです。
"Everybody's in Showbiz"のclosingの"Celluloid Heroes"をギターで弾き語りしながら。僕の人生がノンストップのハリウッド映画だったらよいと思う、だってフィルムの中の主役たちは痛みを感じることがないのだから。あーもう泣いた。子供たちには迷惑そうだ。
"Arthur - Or The Decline And Fall Of The British Empire"の"She's Bought a Hat Like Princess Marina"。彼女はマリーナ王女のような帽子を被り、公的行事(窓掃除や階段掃除)に参加する。彼はアンソニー・ギデンス(イギリスの有名な社会学者)のような帽子を被るがロールスもベントレーも買うお金がなくて中古のフォードを買う。んでブリッジ越えた三番で泣くのですな。やっぱり子供たちには迷惑そうだ。いいじゃん（<-酔っ払ってます）。

■ "フランツ・フェルディナント"

なんて書いておいたら。
"フランツ・フェルディナント"

アレックスのボーカルはキンクスのレイ＝デイヴィスを彷彿させるメランコリックな声質（そしてメンバーのコーラス）。曲の転調の仕方さえもキンクスしている。（新訂カンタン系より。）

これは聴きに行かなくては。

■ さいとにふりがながつきます

ひらひらのひらがなめがね。 ソースはいつものARTIFACT@ハテナ系。
さっそくやってみました。
http://trans.hiragana.jp/ruby/http://d.hatena.ne.jp/pooneil/
うーん、キュート。英語の読みを付けてくれると完璧なのだけれど。
こぐにてぃぶ ぶれいん りさーち ぜろさん
Cognitive Brain Research '03
みたいに。あと、（笑）に「かっこわらい」というふりがなが付くのは笑った。

■ Vision Research 7月号

"Improvement of visual acuity by spatial cueing: a comparative study in human and non-human primates."
"Magnocellular involvement in flanked-letter identification relates to the allocation of attention."

■ Nature 5/13

"Think harder about ecstasy."
"Psychedelic drugs: The ups and downs of ecstasy."

■ Nature Neuroscience 5月号

"Visual and action cues contribute to the self-other distinction."

■ JNS 5/12

JNS 5/12

• "Interaction between Perirhinal and Medial Prefrontal Cortex Is Required for Temporal Order But Not Recognition Memory for Objects in Rats."

■ 伝染するあくび("contagious yawning") つづき。

関連記事を漁っときます。
まず原著論文：

• Cognitive Brain Research '03 "Contagious yawning: the role of self-awareness and mental state attribution."
• European Journal of Pharmacology '98 "The neuropharmacology of yawning."
• "Psychological Influences on Yawning in Children."

これにほぼ全てがあります：

• "Google Answers: Yawning"

いろんな動物が欠伸をする画像。かわいいです：

• "Yawns Are Contagious!"

その他いろいろ：

• "Neuroscience for Kids - Contagious Yawning."
• "ABCNEWS.com : 20/20: Are Yawning and Laughing Contagious?"
• "Why do we yawn when we are tired? And why does it seem to be contagious?"
• "USATODAY.com - Catching yawns keeps us together..."
• "Yawning: It Isn't About Oxygen Anymore."
• "Contagious Yawning in the Infant."
• "Ask Us @ U of T: Why do we yawn?"
• "Yawning may signal empathy - University Chronicle - Diversions."(グーグルのキャッシュ)

というわけでCognitive Brain Research '03あたりまでたどりついて、theory of mind、mirror test、self-consciousnessあたりまで行きたいのだけど。

■ JNP8月号

• "Activity of Rostral Superior Colliculus Neurons During Passive and Active Viewing of Motion." Richard J. Krauzlis
• "Impact of Noise on Retinal Coding of Visual Signals."
• "Functional Stability of Dorsolateral Prefrontal Neurons." Fraser A. W. Wilson
• "Decoding Continuous and Discrete Motor Behaviors Using Motor and Premotor Cortical Ensembles."
• "Optimal Impedance Control for Task Achievement in the Presence of Signal-Dependent Noise." Mitsuo Kawato
• "BOLD Repetition Decreases in Object-Responsive Ventral Visual Areas Depend on Spatial Attention." R. J. Dolan

■ あくびが伝染するチンパンジー

新聞に載ってた霊長研松沢先生の発表。たとえば
"チンパンジーもあくび“伝染”、人間以外で初めて確認"(Yomiuri Online)
件の論文は"Proceedings of the Royal Society: Biological Sciences, Biology Letters"に掲載された"Contagious yawning in chimpanzees."で、目次はこちら。"Proceedings of the Royal Society: Series B: Biological Sciences"の姉妹誌のようなものらしい。
アイちゃんにあくびが伝染するところを記録したビデオファイル(mpeg)はこちらから落とせます(フリーです)。ほかのチンパンジーのあくびをモニターで見てアイちゃんがあくびしてます。これがたんなるまねっこではなくて、本当にあくびが伝染しているのか、つまり、あくびのまねっこと本当のあくびではあくびの深さが違うわけで、そのへんまで併せて確かな知見のか興味があります。そもそも、人間のあくびが伝染するって確立しているのでしょうか。というわけでPubMedでcontagious yawningで検索するとありました。
Cognitive Brain Research '03 "Contagious yawning: the role of self-awareness and mental state attribution"
んで、そこにあったreferenceの

• R.R. Provine, Faces as releasers of contagious yawning: an approach to face detection using normal human subjects. Bull. Psychon. Soc. 27 (1989), pp. 211-214.

  Abstract: 360 psychology students were divided into 12 experimental groups and participated in a single experimental session. The yawn-evoking potency of variations in a 5-min series of 30 videotaped repetitions of a yawning face were compared with each other and with a series of 30 videotaped smiles to determine the ethological releasing stimulus for the fixed-action pattern of yawning and to understand the more general process of face detection. Animate video images of yawning faces in several axial orientations evoked yawns in more Subjects than did featureless or smiling faces, and no single feature, such as a gaping mouth, was necessary to evoke yawns. The yawn recognition mechanism is neither axially specific nor triggered by an isolated facial feature.

• R.R. Provine, Contagious yawning and infant imitation. Bull. Psychon. Soc. 27 (1989), pp. 125-126.

  Abstract: Suggests that the neonate's presumed ability to imitate the facial expressions or gestures of adult models may be the result of ethological fixed-action patterns released by sign stimuli. Contagious yawning (CY) of adults is a precedent for such a facial fixed-action pattern (i.e., a yawn) triggered by a facial stimulus (i.e., an observed yawn). The study of CY can provide insights into both the problem of infant imitation and the more general issues concerning the detection and processing of information about faces. CY also provides a reliable classroom demonstration of released behavior.

• R.R. Provine, B.C. Tate and L.L. Geldmahcer, Yawning: no effect of 3-5% CO2, 100% O2, an exercise. Behav. Neural Biol. 48 (1987), pp. 382-393.
• G. Schino and F. Aureli, Do men yawn more than women?. Ethol. Sociobiol. 10 (1989), pp. 375-378.

なあんだ、けっこうあるではないですか。しかもこのR.R. Provineという人がその道の権威っぽい。というわけでこんどはこの名前でググってみると、この人がUniversity of Maryland Baltimore CountyのDepartment of Psychologyの教授であることがわかります。しかも、"contagious yawning"だけでなく、"contagious laghter"、つまり笑いが伝染することについて単行本を出しているようです。おもしろいなあ。
"Contagious yawning and infant imitation"なんてのが扱われているということは、上記の松沢先生の論文でも、imitationなのかcontagious yawningなのか、という問題については扱われていそうです。
んで、松沢先生の論文のfull-textは入手できないんだけれど、アブストみるかぎり、この話はself-awarenessと関係してくるわけですな。自己意識、ミラーテスト、共感。このへんに関しては上記のCognitive Brain Research '03のメインテーマでもあります。
追記："contagious"のつづりを間違えていたのを修正(ガヤサンクス)。

■ 武蔵書店

せっかく青山ブックセンターのことを思い出したので、ついでに、と言っては悪いが、武蔵書店のことも思い出してみた。私が茗荷谷に生息していたころ、夜中12時とかになってなぜか妙に本が恋しくなって、自転車乗ってお茶大の正門前から本郷通りと不忍通りの交差点を越え、新大塚の三叉路を越え、都電の踏切を越え、池袋駅の臭い地下道を潜って池袋北口を越えてゆるい坂を下って山手通りと交わる要町交差点の武蔵書店まで通っていたのでした。岩波文庫の品揃えが妙によくて、行くたびに徒然草の章を立ち読みしたり、背伸びしてベルクソンとか買ったりしていました。1980年代後半。なんかあのころ、ABCでも武蔵書店でも水戸街道を松戸へ進む道でも、その先に何かがあるような昂揚感があって、それでなんにもなくて、それでもめげないでまた同じ道を繰り返し進んで、それでも満足だったんです。私はロマンティシズムだけで生きていました。"I could dream all day"*1(by Posies). なんにもなくてもいいと思ってたんです。"I remember the good-old days"(by Neil Young)ですな。いいじゃん、べつにこういうのも。今日からこのサイトは私の生まれ育った東京での自転車での日々を追憶する日記となりました（<-ウソだって）。次回は広尾から南砂まで明治通り(環状五号線)全制覇ルートです(<-マジかよ)。その次は、外苑東通りとつながるはずだった幻の環状三号線の名残りの播磨坂、言問通り、三つ目通りな(<-もういいって)。
追記；やっぱりいくつか間違っていたので修正。

*1：追記：All dayに仮定が入っている仮定法だから、canではなくてcouldでした。「一日中だって夢を見ていられる」ですな。

■ Nature 7/22

• "Conceptual precursors to language."
• "Comparison of population coherence of place cells in hippocampal subfields CA1 and CA3." JAMES J. KNIERIM。海馬のCA1とCA3とでの違いを示しています。さらに関連論文として"A Double Dissociation between Hippocampal Subfields: Differential Time Course of CA3 and CA1 Place Cells for Processing Changed Environments."があります(情報提供fromガヤ、サンクス）。以前にも書いたように、area間のinteractionを見る、というのがsingle-unit recordingを越えるための最小限の一歩なわけですが、CA3-<CA1はひとつのシナプスしか結合してないわけで、そのあいだでの違いを見出すというのは凄いしすばらしい。もちろん、この機能局在は大いにありうることでありますが。</li>

追記：JNS 7/12"Differences in Hippocampal Neuronal Population Responses to Modifications of an Environmental Context: Evidence for Distinct, Yet Complementary, Functions of CA3 and CA1 Ensembles."も貼っておこう。

■ Neuron 7/22

• "Class-Specific Features of Neuronal Wiring."
• "Multisensory Integration of Looming Signals by Rhesus Monkeys."

■ 日記・つぶやき・思いつきは書かない

日記・つぶやき・思いつきは書かない
技術系サラリーマンの交差点より。

• 日記は書かない
• つぶやきは書かない
• 思いつきで書かない

私のところもいわば技術系サイトなので結果的にこれを実践しているところがあるけれど、これで本当によいかどうかはわからない(<-これはつぶやきだな)。「固すぎる」「おもしろくない」と言われないようにしたいとも思うし。以前Gouldさんがコメントしたように、サイトにとってある種のキャラ立ちが大事なのは確かだし。というか下に続く。

■ あなたのブログはどのタイプ？

あなたのブログはどのタイプ？
ソースはARTIFACT@ハテナ系。
いつもどおり遅延を入れて今さら貼ります。
私がやっていることもオンラインにある論文に言及してそれを記録してゆく、という意味ではブログの定義に含まれるのでしょう。話題は専門的なところに限られているのだけれど。私がやっていることは、そういった読む価値のある論文をメモり、必要なら最小の説明を加えるだけでなく、論文をただ読んだだけでは出てこないような指摘を加え、その論文の本質に迫ることを目標としています。*1それはそうそう成功しないのだけれど、ガヤ論文とNewsome論文に関してはかなり迫ることができたのではないでしょうか。そういう意味では私がやっていることは日々の生活雑記ではないし（実名でやっている以上、それは抵抗があります）、あんまりweb日記、という感じではないのかもしれません。「日誌」ですな。それが私がconfidential matterを守りつつも有意義のあるやり取りを交わすにはどうすればよいかというひとつの案なのです。
そうやって考えれば私がやろうとしていることはエフェクター型のうちのエンハンサー型（「よそのネタ(=online publication)の考察を深める」）だし、こまめに日々出版される論文にまんべんなく要約をつけてゆくエフェクター型のうちのコンプレッサー型（「よそのネタを要約する」）を目標としているわけではないのですな。もちろんそれ自体は意味があるわけです。Journal clubのネタ探し用に使ってもらうならそれがよいことでしょう。そして怠けているときは単に論文へのリンクだけを列挙するサンプラー型（「よその情報をたくさん列挙する」）となることもあるわけですが、サンプラー型であるためには安定して情報提供をしなければならないわけで、そういうわけでたまにサンプラー型になるってのはあくまで自分のため、あとで深く考察する候補のひとつとして記録してゆく、という役割を果たしているのです。私のところでは。
というわけでセレクションかけた論文を深く読み込む方向に進んでいこう、と確認したのでした。「pooneilの脳科学論文考察日誌」です。あー、また偉そうなこと書いた。前口上はいいからさっさとやればよいのだけれど、こういうことを語るのも大好きなのです。

*1：もちろん可能ならば関連論文に言及してさらに議論を一般化させることによってその分野がどこまで進み、どこまでいけるのか、そこまでいければよい、と思っています。そこまではまだ到達できていないし、本当はNewsome論文に関してはここから先が、neuroeconomicsの将来性、行動分析と神経科学との関係、といったところまで食い込めるチャンスなのですが、息切れしております。

■ clustering

そうか、linear discriminant analysisとmultidimensional scalingとはsupervisedであるか否かの点で別物か。そりゃそうだった（情報提供from ガヤ）。というわけでメモメモ。

• "Some Data Mining Methods"（これも情報提供from ガヤ）
• "Statistical Pattern Recognition: A Review"

■ Psychometric functionの書き方

やっとわかった。こんなこともわからないでいたのです。Psychophysicsの基本中の基本にもかかわらず。

Psychophysicsではdetectionの閾値を決定するのにpsychometric functionを書きます。たとえば図のようなものです。たとえば、二つのターゲットのどちらかが点灯するのでどっちが点灯しているか当てなければならないとします。横軸はターゲットの明るさで、右が明るくて左が暗くなります。縦軸は正答率です。ターゲットのコントラストが明るいときには正答率はほぼ1ですが（右側の青丸）、暗くなるとどっちが点灯しているかわからなくなるので正答率はchance levelの0.5まで落ちます（左側の青丸）。これをlogistic regressionによってfittingしてやって、縦軸の0.75を通るところをその人の検出能の閾値としてやるわけです。しかしlogistic regressionというのは普通は縦軸が0-1の範囲を動くものなので、二択の時にはそれを0.5-1の範囲を動くようにmodifyしてやらなければならないのですが、そのやり方がよくわからなかったのです。

そこで参考サイト："Matlab and Sas logistic"

というわけで、matlabでglmfitを使い、inline関数でfittingしたい関数の形を設定してやればよかったのです。

そこでまず、inline関数で2択(2AFC: two alternative forced choice)、四択(4AFC: four alternative forced choice)、yes-no question (正答率0-1の範囲)のそれぞれの場合のlink関数を設定してやります。

function mylink = choose_link(choice)
% choose link function
% 0:yes-no 0-1;
% 2: 2AFC 0.5-1;
% 4: 4AFC 0.25-1

switch(choice)
  case 1,
    mylink='logit';
  case 2,
    fl=inline('log( (max(0.5+1e-6, min(p, 1-1e-6))-0.5) ./ ...
                 (1-max(0.5+1e-6, min(p, 1-1e-6))))')
    fd=inline('(1-0.5) ./ ( (1-max(0.5+1e-6, min(p, 1-1e-6))) .* ...
                  (max(0.5+1e-6, min(p, 1-1e-6))-0.5))')
    fi=inline('(0.5 + exp(x)) ./ (1+exp(x))') 
    mylink={fl fd fi};
  case 4,
    fl=inline('log( (max(0.25+1e-6, min(p, 1-1e-6))-0.25) ./ ...
                 (1-max(0.25+1e-6, min(p, 1-1e-6))))')
    fd=inline('(1-0.25) ./ ( (1-max(0.25+1e-6, min(p, 1-1e-6))) .* ...
                  (max(0.25+1e-6, min(p, 1-1e-6))-0.25))')
    fi=inline('(0.25 + exp(x)) ./ (1+exp(x))') 
    mylink={fl fd fi};
end

これをchoose_link.mとして保存しておいて、

dat=[0.6021  4  9
     0.6990 12 25
     0.7782  8 14
     0.8451 14 16
     0.9031 11 11
     1.0000  9  9
     1.0792 11 11
     1.1761 10 10];

% [x y Ny]   variable success total
x =dat(:,1);
y =dat(:,2);
Ny=dat(:,3);

mylink = choose_link(2);
[b,dev,stats]=glmfit(x,[y Ny],'binomial',mylink);
xx=min(x):(max(x)-min(x))/100:max(x);
yfit = glmval(b,xx,mylink);

figure
hold on
h1=plot(x,y./Ny,'o');
h2=plot(xx,yfit);
set(h1,'markersize',10)
set(h1,'linewidth',2)
set(h2,'linewidth',2)

データ(dat)からlogistic regressionしてやると図のようなpsychometric functionが書けるという訳でした。

もう少し説明しますと、入力するデータdatとして、一列目がvariable (横軸として振った値)、二列目がsuccess trial数、三列目がtotal trial数という行列を用意します。これをglmfitに入れるわけですが、logistic regressionでは四番目の引数にリンク関数を入れる必要があります。これが'logit'なのが普通の0-1の範囲を動くデータでのlogistic regressionです。そこでchoose_link functionでこのリンク関数をinline関数mylinkとして設定してやるとregressionができて、coefficient bが出てくるのでこれでデータの範囲を100等分した新しい横軸のデータでglmvalを使ってfittingの値を得る、というわけでした。

何とかここまで来れましたが、要するにわたし、inline関数とかeval関数とかのような文字列を評価して計算する、というのがいまだによくわかってないのですね。

glmfitのhelpにたしかに関連することが書いてあるのですが、結局のところ、どのような関数を設定するかは人のサイトのほぼ丸写しでした。うーむ、敗北。

なお、参考ページを見ていただければおわかりのとおり、psychometric functionを書くためにはいくつかのやり方があります。たとえば、今回使ったようなprobit関数 (log(p/(1-p))によるのではなくて、gaussian分布の累積確率密度関数を使ってやるとか。というわけで細かく言うときりないようなのでこのあたりにて。

■ はてなアンテナのリンクはスケールフリーネットワークだった。

ガヤ、サンクス。なるほど、scale-free（3/17,3/31,4/6にて言及あり）の話でしたねこれは。というわけで7/20の図1を確率密度分布に変換して(各月の総リンク数で縦軸を割る)、縦軸横軸を両方ともlogスケールにしたものが今日の図3の左です。横軸はあるサイトがアンテナに登録されている数k、縦軸は被リンク数kのサイトの全サイトに占める割合P(k)です*1。7月分重ねてありますがどれも同じ傾向ですので色分けしておりません。きれいな直線的関係(power law)を示しているのがわかります。

ここで解説を。WWWのようなネットワークの個々の頂点vertexが他のvertexと何個繋がっているか(k)の確率密度分布(P(k))は以下のようなpower lawによって説明できることがわかっています。

P(k) ~ k-γ
log10(P(k)) = log10(k) - γ
 (実際にはintersectの項が入るが、WWWでは0になるらしい)

参考文献：Science '99 "Emergence of Scaling in Random Networks."

なお、このpower lawはネットワークが(1)元からあるネットワークに新しい結合が付加されてゆく、(2)新しい結合はランダムに付加されるのではなくて、よりkの大きいところにより多く新しい結合ができる("rich-get-richer phenomenon")、という二つの性質を持っているときに成り立ち、ランダムな結合では成り立ちません。ですので、ryasudaさん、リンクの分布がpoisson-likeであると書いたのは私の早とちりでした。全員がランダムにリンクしたらポワソン分布になるのはその通りだと思います。実際にpoisson分布だったらどんなプロットになるか作ってみたのが図の右側です*2。縦軸横軸は左図と同じです。実際のはてなアンテナのデータではλ=3(kの期待値=2.8より)ですので、それでプロットしたのが赤い線、λを10.^(-10:0.1:1)でふってみたのが青線です。どのようなλであれ、poisson分布の時にはk>100であるような頂点はほとんどありえません（P_(k=100) < 10^(-100)）。k>100のようなサイトは"rich-get-richer phenomenon"によって形成されるのであって、偶然にはほとんど作りえないということがわかります*3。この二つの対比(左のpower lawと右のpoisson分布)こそがはてなアンテナの被リンク数が上記の(1)(2)の性質を持っていることの証拠となるでしょう。

左の図に戻ります。1月から7月までのそれぞれの月のデータはほとんど同じパターンを作っており、これはガヤが指摘するようなscale-freeであることの証拠といえるのかもしれません。また、各月のデータでlinear regressionして得たslopeからこのネットワークのγを推定することができますが、intersect=0の条件(横軸縦軸ともに10^0を通る)の元で、2.10±0.02 (mean±SD)となります。これは上記のScience '99でのWWWの例でのγが2.1±0.1であるのと劇的な一致を示します。実のところ、はてなアンテナの被リンク数とは、WWWのリンク数のような双方向的なものではなくて、はてなダイアリーを使ってないけどはてなアンテナだけは使っているという人もいるのにもかかわらず。自分で計算しておいて驚いてみたり。

*1：k=0のデータは除外して計算しております。

*2：ネットワークでは結合のない頂点はないものと見なされますので、結合数k=0のものは除いて、1<=k<∞でΣP(k)=1となるようにnormalizeし直してあります。

*3：なお、Watts and StrogatzのNature '98でのsmall-world networkはlocalに繋がったランダムなネットワークの結合のある一定の割合を遠い場所につなぎ直したものですので、この場合P(k)の分布はランダム結合の場合と同じであり、scale-free power lawは成り立たない、ということがScience '99に書かれています。Scale-freeとsmall-worldは似ているようで微妙に違ったものであるようです。

■ いつもググって探すので貼っとこ。

"パワーソフト ＨＴＭＬ特殊文字一覧"

■ "はてなアンテナ被登録数"

"はてなアンテナ被登録数"の統計が出ていたのでヒストグラムを書いてみました(図1)。横軸ははてなアンテナ被登録数(logスケール。0と1はomitしてあります)で、縦軸はそれぞれの横軸に該当するidの数です。それぞれのプロットは1月から7月までの毎月の計測データで、色分けしてませんが、だんだん増える方向にあります。注目する点としては、分布の形自体は変化がないのですね。

というわけでこれをcumulative plotにしたのが図2です。横軸は図1と同じで0と1は計算から除外しています。縦軸Pは累積データの全体のデータに占める割合です。スケールはprobitスケール、つまりP-valueをZ valueに変換したものです（MATLABでいうところのnorminv(P,0,1)）。もし分布がgaussianならこのプロットは直線になります。じっさいにはpoisson-likeですが。青線は各月のデータですが、ほとんど重なっていることがわかります。赤丸を赤線でつないだid:pooneilは順調に被登録数を上げていき、7月現在で上位10％まで来てます。専門的なサイトにしては健闘していると言えるでしょう。

■ Neuron 5/27

"Multiple Spotlights of Attentional Selection in Human Visual Cortex."

■ JNS 5/26

"Encoding-Specific Effects of Social Cognition on the Neural Correlates of Subsequent Memory."

■ Nature Neuroscience 6月号

• "Perceptual learning and top-down influences in primary visual cortex." Charles Gilbert
• "A sensory signature that distinguishes true from false memories." Daniel L Schacter
• "Selective neural representation of objects relevant for navigation."

■ PNAS 5/25

"Dynamic mapping of human cortical development during childhood through early adulthood."

■ Spatial hemineglectの原因部位

Spatial hemineglectは主に右半球のparietal cortexの損傷で起こり、左視野を無視するようになります。左半球の損傷の例は少なく、障害の程度も少ないことがわかっています(右脳左脳なんて言いますが、これこそが人間の脳の左右差を示す一番はっきりしたものであると言えます)。一番印象的なのは、時計の絵を患者さんに模写してもらうと右半分だけを書いた絵になる、というものでしょう。
んでもってその原因部位は右半球のparietal cortexのうちのIFG (inferior frontal gyrus)からTPJ(temporoparietal junction)のあたりということでだいたい考えられていたのですが(前述のJon DriverのNature Neuroscienceの図1を参照)、2001年になってUniversity of TübingenのHans-Otto KarnathがNatureに
"Spatial awareness is a function of the temporal not the posterior parietal lobe."
を出しました。Karnathはこれまでの研究ではneglectのある患者さんにはhemianopia (optic radiationの損傷による視野欠損:blindsightの原因になるやつです)も併発している例が多い(ある例では80%)ことに注目し、hemianopiaのない、純粋なneglectの患者さんのデータだけにしぼってその損傷部位を調べると、じつは一番頻繁に損傷が見られたのは前述のIPL、TPJではなくて、そのすぐventral側のSTG(superior temporal gyrus)であることがわかったというものです。しかも確認のため、neglectとhemianopiaの両方の症状がある患者さんの損傷部位を調べると、これまでの報告と同様、IPLとTPJでの損傷が多く見られたのです。損傷していた右のSTGの反対測、左のSTGはいわゆる言語野であって、そのためKarnathはnon-human primateとhumanとに分かれる進化の過程で左STGが言語野としての専門化することによって右STGが注意をつかさどる領域として専門化した、というspeculationをするのです。
一方、これはかなりcontrovercyを惹き起こしたようで、これに対する反論などがCortex誌上で行われたらしいのですが私のところからは読めません。その代わり、私が知るかぎりでは、NeuroReport '03において、
"The anatomy of neglect without hemianopia: a key role for parietal-frontal disconnection?"
という論文が出版されてます。ここで著者らは、KarnathのNature論文での損傷部位は急性期(出血などが起こった直後)のものを見ている点に注目して、慢性期に入った患者さんのうちでKarnath論文と同様、neglectのみがあってhemianopiaがない患者さんの損傷部位を調べました。すると一番頻繁に見られた損傷部位はKarnath論文のようなSTGではなくて、SMG(supramarginal gyrus、IPLの一部)だったのです。というわけで著者らはKarnath論文の結論は一部言い過ぎであり、気をつけて扱うべきである、としています。
一方で、KarnathはCerebral CortexのAOPにおいて、
"The Anatomy of Spatial Neglect based on Voxelwise Statistical Analysis: A Study of 140 Patients." Hans-Otto Karnath
というのを出版しており、140人の患者さんの損傷部位の解析から元のNature論文と同様な結論を導いています。なお、このCerebral Cortex論文はNeuroreport論文をreferしておらず、acute、chronicの問題には触れていなさそうです。

■ 青山ブックセンターが倒産

なんてこった。私の青春の一ページですよあそこは。渋谷でのバイトでの帰りに自転車で寄ってあそこでサブカル系の漫画やらニューエイジ系の本などを読み漁ったものです。背伸びして洋書を買い込んだり。建築系とかのでかい写真集立ち読みしたり。夜想とかバロウズとかそういうものに出会える唯一のところでした。ベイトソンの「天使の恐れ」を買ったのもあそこではなかっただろうか。今にして思えば、ヴィレッジヴァンガードほど旧宝島文化くさくはなかったし、丸善ほどはおっさん臭くなかったし、リブロとも違う、今でもほかにない存在でありつづけたのですよね。そして明け方までの営業時間。渋谷で飲んだ帰り、自転車こいで西麻布とか六本木とかの町に目もくれずABCに寄って、ふらふらしながら立ち読みして、なんも買わず、もしくはやっすい雑誌をなんか買って、そんでそこから赤坂、銀座を経由して永代橋を越えて帰っていってたんです。若いなあ。それはまだBOOKOFFもTSUTAYAもないころの話でしかないのだけれど。

■ Annual Review of Neuroscience

"NEURONAL CIRCUITS OF THE NEOCORTEX." Rodney Douglas and Kevan Martin。
Douglas and Martinと言えば、1991年のJournal of Physiology四連報ですな。

• "An intracellular analysis of the visual responses of neurones in cat visual cortex."
• "Mechanisms of inhibition in cat visual cortex."
• "Excitation by geniculocortical synapses is not 'vetoed' at the level of dendritic spines in cat visual cortex.."
• "A functional microcircuit for cat visual cortex."

麻酔下でV1からintraで記録しながら視覚刺激を与えるという方法論によって、V1ニューロンの視覚刺激応答等のパターンがいかにしてできているかをその回路とともに解明したのです。以前シナプス応答レベルの仕事をしてから行動動物のsingle-unitを記録するようになった私としては、これらの論文を読んだとき、これだ、と思いました。つまり、シナプス応答や回路のレベルでどういうことが起こっているかを動物の行動と結びつける、ということをするための一番の到達点だと思ったのです。それ以降私はV1ニューロンの応答と回路というものに興味を持ち、それがある種のカノニカルなものであるという作業仮説の下にやってきたと思います。
そののちで私の興味は多電極記録へと移行しましたが、スパイクを見るだけではなくてsynapticなイベントを見なければ、ニューロンの入力(PSP)から出力(スパイク)を変換する過程が見れていない、という意味での重要性がまったく薄れていないのは確かです。
In vivoでのintraというアプローチはのちにFregnacのNatureでの刺激応答時のshunting inhibitionの発見、さらにDavid Fersterによる膜電位のup- down-stateの発見などへとつながってゆきます。また、1991年以降にはoptical imagingによるV1のfuncitonal organizationの解明が劇的に進みました。このannual reviewでどのくらいそのへんが盛り込まれて進歩しているか、というのに興味があります。

■ Annual Review of Neuroscience

• "THE MIRROR-NEURON SYSTEM." Giacomo Rizzolatti and Laila Craighero
• "THE MEDIAL TEMPORAL LOBE." Larry R. Squire, Craig E.L. Stark, and Robert E. Clark
• "CORTICAL NEURAL PROSTHETICS." Andrew B. Schwartz。今まで彼が使っていたdecodingのアルゴリズムはたんなるpopulation vectorだったんだけど、ちらっと見たらカルマンフィルター、なんて書いてある。少しは改良しようという意志はあるらしい。
• "ATTENTIONAL MODULATION OF VISUAL PROCESSING." John H. Reynolds and Leonardo Chelazzi。Desimone傘下がV4ニューロンのattentional modulationについて書いている模様。

■ Current Opinion in Neurobiology Article in Press

ガヤのコメントにより追記。
"Processing of complex stimuli and natural scenes in the visual cortex." Peter König。
Current Opinion in Neurobiologyは

• 2月号 Development
• 4月号 Cognitive neuroscience
• 6月号 Signalling mechanisms
• 8月号 Sensory systems
• 10月号 Neuronal and glial cell biology
• 12月号 Motor systems

となっているので、8月号 Sensory systemsの原稿でしょう。
Natural sceneとV1という関連では

• Science '00 "Sparse Coding and Decorrelation in Primary Visual Cortex During Natural Vision."
• Nature '96 "Emergence of simple-cell receptive field properties by learning a sparse code for natural images." Olshausen

あたりが重要論文でしょう。

■ コメントしてくだった皆様へ

いつもコメントありがとうございます。うまく繋がったスレッドに関してはniftyの方のホームページに編集したものを掲載していますが、これまでのものについてはコメントを掲載する許可をいただいていなかったのでコメントは掲載していませんでした。もしよければ今回のNewsome論文およびMilner論文以降はみなさまのコメントも掲載させていただきたいと思いますがよろしいでしょうか。それ以外に転載したくなった場合には改めてお願いをしますので。なお、この件については0000年00月01日の注意書きのところにも記載を入れました。

■ Science Newsome論文

放置してましたがまだ続けるつもりはあります。とくにmmrlさんが送ってくださったエントリ(6/31)およびJCについての報告に関しては忘れずやります。

■ Science

"Cognitive Imitation in Rhesus Macaques."

■ Nature Neuroscience 7月号

"Automatic avoidance of obstacles is a dorsal stream function: evidence from optic ataxia."
つづき。
Optic ataxiaに関する重要な論文にGoodale and Milnerの
Nature '91 "A neurological dissociation between perceiving objects and grasping them."
があります。以前にも言及しましたが、visual agnosia (視覚認知ができない)の患者さんであるDFさんは目の前のスリットの角度がわからないにもかかわらず、このスリットにカードを差し込むことはできます。一方、optic ataxiaの患者さんでは話は逆で、スリットの角度はわかるのに、そのスリットにカードを差し込むことができない、というわけです。
つまり、視覚意識がないのに視覚運動変換ができる場合と視覚意識があるのに視覚運動変換ができない場合というdouble dissociationを示したわけです。さらに彼らは"Visual brain in action"(MIT press)においてその二つがdorsal pathwayとventral pathwayとに分かれている、といった説を展開することになります。
今回の論文の著者であるRossetti and Vighettoは最近EBRにoptic ataxiaに関するreviewを書いていて、上記のGoodale and Milnerの説を批判しています。
"Optic ataxia revisited: Visually guided action versus immediate visuomotor control." Yves Rossetti, Laure Pisella and Alain Vighetto
つまり、前述のとおり、optic ataxiaでは注視点へ手を伸ばすのには問題がないわけで、optic ataxiaの場合のテストは周辺視野で行っており、中心視野で行っていない。一方でvisual agnosiaの場合のテストは中心視野で行っており、周辺視野で行っていない。よって、二つの症状を比較するためにはどの視野でのことなのかをそろえて検証すべきだ、というわけです。んで、このレビューが出た後の今回のNature NeuroscienceにはMilnerが入っている、というわけなんですな。
なお、Rossetti and Vighettoの代表作は
"Optic ataxia: a specific disruption in visuomotor mechanisms. I. Different aspects of the deficit in reaching for objects." Perenin MT, Vighetto A
こいつです。Brainなんですが、Iとか書いてあって連報のように見えて、続報が出てないのです。かっこ悪い。内容は別として。

■ JNS 7/14

• "Target Selection in Area V4 during a Multidimensional Visual Search Task." 小松研の小川さんのbottom-up / top-down attention taskが掲載されてる。おめでとうございます。
• "Temporal Dynamics of Neural Adaptation Effect in the Human Visual Ventral Stream." こちらもあるので今回のJNSのBEHAVIORAL/SYSTEMS/COGNITIVEセクションは生理研祭りですな。
• "Independent Coding of Reward Magnitude and Valence in the Human Brain." rewardのmagnitude (small or large) and valence (win or loss)がERPのP300とfeedback negativityとでdouble dissociationする。追記：mmmmさんによるコメントがあります。それからCamille et al. (2004) Science 304:1167-1170は5/22にリンクした"The Involvement of the Orbitofrontal Cortex in the Experience of Regret."です。

■ Nature Neuroscience 7月号

"Automatic avoidance of obstacles is a dorsal stream function: evidence from optic ataxia."
つづき。
じつは著者らはほぼ同じタスクを使ってspatial hemineglectの患者さんで同じテストをしています。spatial hemineglect(半側空間無視)は主に右のPPCの損傷によって左視野半分への注意が向かなくなる、というもので、基本的に視覚注意の障害です。
"Preserved obstacle avoidance during reaching in patients with left visual neglect." Neuropsychologia '04
こちらでは結果はまったく逆で、円柱のあいだを手を伸ばすときには、円柱の位置によって手の軌道に変化を受けます。つまり健常者とまったく同じで、automatic avoidanceは可能です。しかし、円柱の中間を示すタスクではちょうど真ん中を指すことが出来ません。これは左側の円柱が無視される影響で中心より右側を指すということが起こるためです（じつは結果はしょぼいのだけれど）。
つまり、この二つの論文の結果を合わせると、double dissociationが起こっていることがわかります。つまり、optic ataxiaもhemineglectもおなじPPCの障害によって起こる症状であるにもかかわらず、optic ataxiaの方ではautomatic avoidanceの機能のみに、hemineglectの方では視覚注意の機能のみに障害が起こり、別の機能には障害がありません。つまり、optic ataxiaとhemineglectとで傷害される部分は別の独立した機能を持っていることがわかるのです。
それではじっさいの障害部位はどこか、といいますと、
"Two different streams form the dorsal visual system: anatomy and functions." Giacomo Rizzolatti and Massimo Matelli
によりますと、上のほう(SPL)が傷つくとoptic ataxiaになって、下のほう(IPL)が傷つくとhemineglectになる、ということのようです。じっさいには単純にSPLとIPLとに分けられるかどうか疑問でして、optic ataxiaの方がparietooccipitalである、というように書いている場合もあるようですが。なんにしろ、Rizzolattiはそれまでのanatomyなどの結果から、PPCには二つのpathway、SPLを通る経路とIPLを通る経路とがある、ということを提唱しています。（じつは、ventral pathwayでも単一の経路があるのではなくて、STSの中を通るような別の経路がある、という話があるんですが、それはまたいつか。）しかし、Rizzolattiはいろんなことやってますな。
なお、PPCのもう一つ重要な機能としてbody schemaの形成というものがありますが、これも二つの症状で現れ方が違っておりまして、optic ataxiaの患者さんの多くは、自分の体を指差すときには不思議と問題がなかったりします。一方、hemineglectの患者さんはしばしば空間を無視するだけでなく、自分の体の半分も無視するという現象が起こります。つまり、IPLのほうがおそらくはbody schemaの形成に関わっているということでしょう。(>>Correggioさん、合ってますか？)
明日つづきを貼ります。これで最後。Goodale and Milnerに関連して。
追記：Rizzolatti and Matelliでoptic ataxiaとneglectについてどう書いてあるか貼っときます。

Lesions centered on SPL determine optical ataxia (Ratcliff and Davies-Jones 1972; Perenin and Vighetto 1988). Lesions of the right IPL, especially its lower part, produce neglect (Vallar and Perani 1987; Perenin and Vighetto 1988). (中略) These data suggest a clear dichotomy between the functional roles of SPL and IPL. SPL is involved in action organization. In contrast, IPL is deeply involved in perception, but it is also involved in the organization of motor activities.

というわけでSPLとIPLという言葉はhumanのものですので、ご隠居の誤解ではありません。Correggioさんも書いているようにRozzolattiは相同に関しては回避している模様です。

■ Nature Neuroscience 7月号

"Automatic avoidance of obstacles is a dorsal stream function: evidence from optic ataxia." "The visual brain in action"をGoodaleと書いたDavid Milnerです。それからoptic ataxia関連の論文を書いてきたRossetti and Vighetto。Posterior parietal cortex (PPC)の障害でoptic ataxiaの症状がある患者さん二人へのテストの結果です。
Optic ataxiaとはなにかというと、視覚は正常で、物がどこにあり、何なのかもわかっているのにもかかわらず、それを手を伸ばして掴むことができない、という症状のことです。後述のRizzolattiのEBRによれば、"a disorder of visually guided movements of the arms toward a goal"です。この障害は、その物体が視野のはしっこにあるときにより厳しく、物体を視野の真ん中で見ている(foviate)ときには問題にならなくなります。
んでもって実験パラダイムはFig.1の通りですが、テーブルの向こう側に注視点があってそこを注視しながら手を伸ばして注視点に触れることが要求されています。手を伸ばす途中には円柱が二本、手が通るあたりから10cm横の左右に置いてあります。この円柱は手を伸ばすときに当たることは決してありません。しかしこの円柱の位置を左右に4cmほどずらしてやると、このタスクをコントロールの健常者がやるときには手の軌道がこの円柱を避けるようにわずかに逸れます。被験者はこのような微妙な調節を意識してやっているわけではありませんので、これは"automatic avoidance"です(円柱が手の軌道に近いところに置かれているときには意識してそれを避けて手を伸ばすので、automaticではありません)。しかし、このタスクをoptic ataxiaの患者さんにやってもらうと、そのような手の位置の調節がなく、円柱の位置によらずいつも同じ手の軌道を描くことになります。*1 つまり、optic ataxiaでは、視覚誘導性のreachingの障害だけではなくて、このようなautomatic avoidanceにも障害があるということがこの論文でわかったのです。なお、視覚には障害がないということを示すためのコントロールとして、別のタスクでこの二つの円柱の中間を指差すように、というタスクをすると、これはまったく問題なくできます。よって、円柱の位置の変化を認識していないということではないのです。
明日つづきを貼ります。
追記：Correggioさん指摘のGallettiらのEBRのreview。
Experimental Brain Research '03 "Role of the medial parieto-occipital cortex in the control of reaching and grasping movements." Claudio Galletti , Dieter F. Kutz, Michela Gamberini, Rossella Breveglieri and Patrizia Fattori
追記：ご隠居のコメント関連。RizzolattiのはBrain '83 "Deficits in attention and movement following the removal of postarcuate (area 6) and prearcuate (area 8) cortex in macaque monkeys."、HeilmanのはArch Neurol '94 "Posterior neocortical systems subserving awareness and neglect. Neglect associated with superior temporal sulcus but not area 7 lesions."ということで合ってますか？ ほかにメジャーな論文としてはGaffanのBrain '97くらいではないでしょうか。この2、3年でneglectの動物モデルでいいjournalに載ったのはないように思います。マーモセットの論文(Behavioural Brain Research '02)をひとつ見つけましたが。んでもって、neglectの種差の問題の参考文献はNature '01 "Spatial awareness is a function of the temporal not the posterior parietal lobe."ですね。あとご存知でしょうが、Nancy KanwisherのCurr Opin Neurobiol '01 "Neuroimaging of cognitive functions in human parietal cortex."はPPCの種間の相同の議論をするのに役立ちそうですね。

*1：なお、前述したとおり、optic ataxiaがあっても、注視しているところへ手を伸ばすことは難しくないそうです。

■ Current Biology

• Magazine "Qualia." Christof Kochによる解説。というか自著"The Quest for Consciousness: A Neurobiological Approach"の宣伝ですな。この本専用のサイトへのリンク "The Quest for Consciousness"で1章と20章が読めます。
• Dispatch "Visual Cortex: The Continuing Puzzle of Area V2." Boynton and Hegdé。伊藤南さんのJNS '04 "Representation of Angles Embedded within Contour Stimuli in Area V2 of Macaque Monkeys."(V2のニューロンがangleをrepresentしている、というもの)に対するコメンタリ。

■ 臨床医のネクタイは病原菌のすみか？米学会で報告

以前書いて忘れてたのを貼ってみます。ってもうソースが消えてるし。

臨床実習先のニューヨーク市内の病院に勤務する医師ら医療従事者が着用したネクタイ４２本で、ほぼ半数の２０本から黄色ブドウ球菌などが検出された。患者と接することがほとんどない警備員のネクタイでは、検出されたのは１０本のうち１本だけだった。

Yomiuri Online 6/2より。ていうか医師のネクタイと警備員のネクタイではなくて、医師のネクタイと医師のシャツとで比較してほしい。もしくはネクタイと手。それと医師/警備員とネクタイ/手との2x2でinteractionを出してくれ、と思うのです。そうしないと、単に医師がネクタイをしなければよいというだけの話なのか、そもそも医師の着るものが充分にきれいになっていなくて、院内感染を引き起こす元となっているのか、ぜんぜんわからない（ニュースの口調からすると前者として捉えられているようだが）、ってニュース記事につける文句ではないですな、これは。

■ Cerebrel Cortex

やっとオンラインのフルテクストが使えるようになったのでpdf取りまくり。

• "Oscillatory Synchrony in the Monkey Temporal Lobe Correlates with Performance in a Visual Short-term Memory Task."
• "Single Cell Integration of Animate Form, Motion and Location in the Superior Temporal Cortex of the Macaque Monkey." David I. Perrett
• "Color Discrimination Involves Ventral and Dorsal Stream Visual Areas." Guy A. Orban
• "Medial Prefrontal Activity Predicts Memory for Self."
• "Experience-dependent Changes in Basal Dendritic Branching of Layer 2/3 Pyramidal Neurons During a Critical Period for Developmental Plasticity in Rat Barrel Cortex." Karel Svoboda
• "Neural Correlates of Change Detection and Change Blindness in a Working Memory Task." Leslie G. Ungerleider
• "Enhanced Temporal Non-linearities in Human Object-related Occipito-temporal Cortex." Rafael Malach
• "Search for Color ‘Center(s)’ in Macaque Visual Cortex." Guy A. Orban
• "Task-independent and Task-specific Age Effects on Brain Activity during Working Memory, Visual Attention and Episodic Retrieval." Lars Nyberg
• "Perception-related Modulations of Local Field Potential Power and Coherence in Primary Visual Cortex of Awake Monkey during Binocular Rivalry." Reinhard Eckhorn

■ Trends in Cognitive Sciences 6月号

"Neuronal representations of cognitive state: reward or attention?" John H. R. Maunsell。世で研究されているattentionやreward expectancyのneural correlateはしばしば分離できていないことを指摘している。その理由としてabstではreward contingencyのパラメータのみがそれらの研究では振られていることを挙げています。このへんの分野の概念の複雑化と曖昧さとを考えるととても重要です。将来この辺の概念はもっと整理され、それぞれの概念間の関係がより確立していくことでまだしばらく先はやることはあるでしょうが*1、次は何か、それが問題なのです。

*1：実際には今まで40年の歴史を見て考えればしばしば複雑化の道を進むだけだったりするのだけれど。

■ Nature 6/17

"Routing of spike series by dynamic circuits in the hippocampus."

■ JNS 6/16

• "Sequences of Abstract Nonbiological Stimuli Share Ventral Premotor Cortex with Action Observation and Imagery."
• "Brain Mechanisms for Inferring Deceit in the Actions of Others." Chris Frith and Passingham。こういうオモロげなのにはかならずChris Frithが入っているな。
• "The Role of the Central Nucleus of the Amygdala in Mediating Fear and Anxiety in the Primate."
• "Improvements in the Signal-to-Noise Ratio of Motor Cortex Cells Distinguish Early versus Late Phases of Motor Skill Learning."

■ Science Andersen論文つづき

"Brain Waves: Cognitive-based Neural Prosthetics"にて、Andersen論文が採り上げられてます。

■ Neuron 7/8

FulltextがScienceDirectのページになってる。なんかダサいな、これ。追記：わかった、そのデカい"neuron"っていうbannerがダサいんだ。

• "Posterior Parietal Cortex Neurons Encode Target Motion in World-Centered Coordinates." またPeter Thierか。"Posterior Parietal Cortex"と書いてMSTの研究なのはなんか馴染まないのだけれど。
• "Coincident but Distinct Messages of Midbrain Dopamine and Striatal Tonically Active Neurons." Hagai Bergman @ The Hebrew University。この間の岡崎のCOEシンポジウムに来てました。いい歳だと思うんだけど、引き締まったジーンズ姿でかっこよかった。

■ Nature 7/8

"News and View feature: The RNAi revolution."

■ Nature 5/20

"Time waits for no man." KEVAN MARTINによるBenjamin Libetの新著"Mind Time: The Temporal Factor in Consciousness"の書評なのだけれど、"ネイチャ-月刊ダイジェスト 私たちは時間には追いつけない."を読むかぎりそうはわからなかった。著者は著者はって書いてるんだけれど、Libetはって書けばよいではないか。原文はそうなってるんだし。翻訳としてそれでは硬いというのだろうか。でも流し読みしたときは著者ってKEVAN MARTINのことかと誤解しましたけどね。そう思うのが普通ではないでしょうか。もっとも、一番悪いのは訳文にはLibetの著書のことがまったく書かれていないことですけどね。と思って紙に印刷されてる方見たらちゃんと書かれてました。それだけ。

■ JNS 7/7

• "The Influence of Sustained Selective Attention on Stimulus Selectivity in Macaque Visual Area MT."
• "Point-Light Biological Motion Perception Activates Human Premotor Cortex."

■ The Journal of Comparative Neurology 5/3

• "Perirhinal and parahippocampal cortices of the macaque monkey: Intrinsic projections and interconnections."

いちおう貼っとこ。

■ Science 7/9

"Cognitive Control Signals for Neural Prosthetics." R. A. Andersen @ caltechでNeural Prosthetics来たっすよ！ 以前からannual reviewとかでもそっちを意識しているのはわかっていたけれど。
タイトルを読んだ印象：いままでのNeural Prostheticsってのは脳の信号を使って物を操作する、つまり運動機能の代替をしてやろうとするものだったわけです。たとえば、NicorelisやらSchawartzやら。んでもって、今回の論文ではもっと高次の指令("cognitive control")を脳から取り出してやろうというわけですな。選択のレパートリーが少なければ（Andersenですから、たとえば二つの選択肢のどっちへのmotor intentionを持っているか、とか）、それ自体は簡単なことのようにも思えるのですが。
アブスト読んでみました。うーむ、たんにM1からの信号ではなくてparietal reach regionからの記録でコンピューターカーソルを動かしただけのようにも思えるのだけれど（そんなもん、M1だろうがPMだろうがPPCだろうが可能な気がするし）。
また、この記録から、Expected value signals (= expected magnitude of rewardやらexpected probability of reward)に関わる信号が記録された、というのもLIPでのsaccadeタスクで見つかってくるのと同じ話だし(この前のNewsome論文、それからPlatt and Glimcher論文とか)。よって話としてはM1やPMからの記録でneural prosthesisするのと比べてメリットがなんであるかが焦点となることでしょう。アブストを見るかぎり、goalに関する情報とvalue signalに関する情報との両方がモニターできる、という点のようなんだけれど、それだけではM1からの記録のadvantageを越えられないように思います。
それは別として面白い問題であるのはたしかです。今回はカーソルを動かすだけのようですが、もしgoalの情報だけが得られて、それでロボットアームを動かしたらどうなるでしょうか。以前盛んに書いたように、goalのpositionという情報は関節の角速度のようなキネマティックな量に変換され、それが筋肉の張力のようなダイナミックな量に変換されます。つまり、goalの情報だけ与えられてもそれを実現するためのキネマティックまたはダイナミックなパラメータの組み合わせは無限にあるのであって、それの中のなにが選ばれるのか、というかいったいなにが起こるのか、ということに興味があります。
以上、まだ本文も図も読んでません。続きます。
追記：SI読んだところ、Plexon使ってるらしい。

■ Nature Neuroscience 7月号

"Deficits in saccade target selection after inactivation of superior colliculus." Edward L Keller @ The Smith-Kettlewell Eye Research Institute。
上丘はサッケードのinitiationだけではなくていろんな認知機能(Horwitz and Newsomeによる"target selection"やPeter Thierによる"covert shift of attention"など)に関わる情報を持っていることが主にsingle-unit recordingからわかっています。しかしそれらの研究に必ず付きまとう問題はそのような機能は上丘が担っているのではなくて、単に大脳皮質で表象されている情報が伝わってきているだけではないのか、といわれてしまう難点があることです。そのためには上丘のサッケードの機能を阻害せずに上丘での"target selection"などの機能だけを選択的に阻害できることを示すことが必要です。これは主にmuscimolを局所的に注入することで行われています。今回の論文もサッケード自体には影響がなくてtarget selectionだけが阻害されるような結果を提示しています。そういえばPeter Thierも玉川のシンポジウムで話をしたときには上丘のlesionやmuscimolによるreversible inactivationが重要である、というような言い方をしてました。あれの場合はサッケードのターゲットとattentionのcueの位置が離れていることから、両者を分離してinactivationすることが可能です。そのうち論文になって出てくるかもしんない。

■ Science 7/2

"Sites of Neocortical Reorganization Critical for Remote Spatial Memory."

■ PNAS 6/29

• "Beta oscillations in a large-scale sensorimotor cortical network: Directional influences revealed by Granger causality."
• "The loss function of sensorimotor learning." Daniel M. Wolpert @ University College London。

■ Science Express 7/1

"That's My Hand! Activity in Premotor Cortex Reflects Feeling of Ownership of a Limb." Richard E. Passingham。
うーむ、self-consciousnessに思いっきり関わる論文ですね。読まなくては。あと、Grazianoのfake handの論文はこれですね。
Science '00 "Coding the Location of the Arm by Sight."

■ Nature Neuroscience 7月号

• "Recalibration of audiovisual simultaneity." NTTの西田先生とCaltechの下條先生の名前が入っている。 私たちが目の前でボールがバウンドしているのを見るとき、バウンドする動きと地面に叩き付けられる音とが同じ物体（ボール）から来ていることを間違えることなく結び付けます。しかし、これはじつは不思議な話で、視覚情報が処理される脳の領域と聴覚情報が処理される脳の領域が違うだけではなくて、それらの処理されるのにかかる時間も違います。つまりそのような光と音との同時性(simultaneity)がどのようにして確立するか、という問題群があります。これはもちろん光と音だけの話ではなくて、視覚情報内でも動きと色との同時性がどう確立するか、という問題があり、そのような同時性が崩れるようなillusionがいろいろ考え出されています。Flash-lag illusionに関しても動きと光の点滅とのあいだでの同時性の問題であるといえます。ひとことで言ってしまえば、binding problem関連ですな。 そしてこの論文では、そのような視覚と聴覚との同時性の確立がその別々の時間に処理されたものを同時である、というふうに再構成している、という視点に立ちます。つまり、視覚の処理が行われた時間t₁と聴覚の処理が行われた時間時間t₂が経験上同時であったとき、この処理のずれt₁-t₂がゼロであるようにrecalibrationされている、という仮説を立てます。重要な点はこのrecalibrationがそれまでの経験によってcalibrateされているということです。よってわざとこの同時性をずらしたような刺激を使ってやってそれにadaptationさせるとこのrecalibrationが起こって同時性の基準がずれる、というのがこの論文でわかったことです。うーむ、面白い。そんなに重要なことが日常の経験から決められているとは。 この話は物体が近くにあるときの話なのだけど、もちろん光速と音速の違いによるcalibraionの問題というのもあることでしょう。
• "Automatic avoidance of obstacles is a dorsal stream function: evidence from optic ataxia." "The visual brain in action"をGoodaleと書いたDavid Milnerです。Parietal cortexにlesionのある患者さん二人へのテストの結果です。これについてはまた。
• "Deficits in saccade target selection after inactivation of superior colliculus." Edward L Keller @ The Smith-Kettlewell Eye Research Institute。これについてはまた。

■ Amon Düül

Amon Düülは全て最高なわけだが。よく言われる1stおよび2nd と3rdとのあまりの違い（ドラムたたきまくり叫びまくりギターリフ繰り返しまくり、からアコギ主体の弾き語り系プラス催眠系ギターへ）について、日和ったと言ってもいいだろうし、政治的メンバーが抜けて音楽的になったというのも本当だと思う。けれど、あれって要するに"chill-out"した、と捉えればよいのではないでしょうか。ひとつのセッションぶっつづけ（20時間とも48時間とも言われる）から編集した1st, 2ndでの狂騒に荒れ果て、そこでレイドバックというかチルアウトしてしまったのが3rdであって、そのような「祭りのあと」感が3rdのに流れている空気だと思うのです。なんかドパミンだかアドレナリンだかが枯渇してしまった状態。それはサイケデリックロックからカントリーロックへと移ったByrdsなどのアメリカのバンドが辿った道ともほぼ同時進行だったのでしょう。そういうわけで、3rdのアウトテイク集が出たら"Chilling-out Düül"なんてタイトルはどうでしょ。

■ ω²

1-way ANOVAでのeffectの強さを示すindexとしてω²を計算してたんですが、値のrangeがなぜか0<ω²<1にならない。というわけで検証してみました。
ANOVAのテーブルを

--	SS	df	MS	F	P
effect	SSeffect	dfeffect	MSeffect	F	P
error	SSerror	dferror	MSerror	--	--
total	SStotal	dftotal	--	--	--

としたときに

ω² = ( SS_effect - df_effect * MS_error ) / ( SS_total + MS_error )

と計算されます。
よってこれの分母は正なので、分子を変形してみます。

SS_effect - df_effect * MS_error
= SS_effect - df_effect * MS_effect / MS_effect * MS_error
= SS_effect - SS_effect / F
= SS_effect * ( 1 - 1 / F )

というわけで、F>1のときだけω²は正であるようです。Web探してもどこにもそんなこと書いてなかったけど。
と書いてみてから、ω²==1になるのはSS_effect == SS_totalになるときだし、SS_effect == 0のときには絶対ω² < 0になる、と考えた方が早かったようです。やれやれ。

■ 6/29へのコメント再録

mmmmさん、その通りですね>>このサイトの意義。こういう論文を交えた話は事実関係のところであれこれやったほうが面白いわけで、いかに深く、核心までたどり着くか、という方向へ行きたいと思っております。また同時に、このことは各方面の研究の将来性と限界とを検討することになるわけで、今後の脳研究がどういう方向へ行ったらいいかを議論するための重要な材料にもなるであろうことを期待しております。ほんと、ここまで行けたらよいと思ってます。

■ 時系列解析

時系列解析での時系列データ内に相関があるのかあたりまえで、そのような相関をどう取り除いていくかというのが時系列解析には必須です。ARとかARMAとかのモデルのようにある時間のデータY(t)がY(t-1)やY(t-2)などからどのように影響を受けているかを取り込んだものもあります。

■ Science Newsome論文つづき

もうちょっと核心に向かいましょう。月曜の朝がjournal clubなもんで。
このScience論文にもいろいろな問題はあると思いますが（叩いて埃の出ない論文はない）、私が重要なものと思うのは、(1) この論文がglobalなmatchingとlocalなmatchingとを明示的に比較するようになっていない、(2) matchingよりももっと簡便な説明変数があるのではないか、という点です。なお、以下の文章はこの論文がacceptされるべきかどうかにcriticalな論点と今後証拠が出てくれば十分であるものとが混ざっています。ご注意を。
(1) この論文がglobalなmatchingとlocalなmatchingとを明示的に比較するようになっていない。これはかなり意図的に回避している感じがありますが、そういうわけにはいきません。まず、behaviorですが、Fig.2にあるようにいくつかのmeasureを持ってきてlocal matching lawがよく行動を説明することを示しているわけですが、これはロジックが間違ってます。Globalなmatching lawが当てはまることはよくわかっているのですから、local matching lawはglobal matching lawでは説明できないようなfractuationを説明できていることを示さなければならないのです。ちょっとまどろっこしいですね、つまり、Fig.2でlocal matching lawで説明できている、としているところからgobal matching lawでも説明できる部分を差っ引いてやるべきなのです。それでも説明力があるときはじめて、local matching lawがglobal matching lawに加えて役に立つ説明として採用されるべきなのです。GLM的に考えてやりましょう。Fig.1の選択を従属変数Y(t)、incomeを説明変数X(t)とします。X(t)はgobal matching lawによるregressor X1(t) (Fig.1Cでの黒い直線）とlocal matching lawによるregressor X2(t) (Fig.1Cでの黒い曲線から黒い直線を差し引いたもの）とに分解できます。それでY(t) = a1*X1(t) + a2*X2(t) + a3*X1(t)*X2(t) というふうにモデルを組んでやることができます。これでcoefficient a1は有意なのはわかっているので、coefficient a2が本当に有意なのは検証してやればよいのです。Fig.1Cなんてチャンピオンデータなんですから、全てがこうだと信用するわけにはいきません。交互作用の項があるのは、global incomeが1:1と1:8とではlocal incomeの違いの選択への影響が変わりうるからです。長くなりました。なんにしろ、彼らはこういうことはやっていません。つまり、読者は彼らの言うlocal incomeというやつにはglobal incomeの影響が足し合わさっていることを忘れてはなりません。じつのところ、global matchingだけが成り立ち、localなfractuationはそのmatchingからの予測のエラーを最小化するような強化学習のパラダイムで考えた方が尤もらしいと思うのです。だからこそ、global matchingかlocal matchingか、という問題はnontrivialなはずなのです。
また、電気生理学的にも、local incomeのことだけ考えているという点には難点があるのは上記の通りですが、要するに話はとしては、LIPのactivityでglobal matchingを説明することはできなかったということです。だからlocalな方へ話を持っていこう持っていこうという流れにFig.2がなっているのです。これはつまり、(a) 非験者はglobal matchingなどしていない、local matchingだけ、(b) 行動としてはglobal matchingもしているんだけれどLIPはそれには関与していない、のどちらかであるのでしょうけれど、この問題を彼らは回避したのです。それはもちろん、(a)のようなことは言うのは行動分析学者の反感を引き起こすでしょうし、(b)のようなことを言うのはせっかくmatchingのことをやろうとしているのに狙うべき領野を間違えた、ということになるのですから。というわけでどっちでも彼らにとって都合が悪いのです。そして我々はそれを責めるべきです。つまり、ここでもglobalなmatchingとlocalなmatchingとの問題を回避した影響が出ているのです。実のところ彼らはglobal matchingなんていらないという立場でやっているのですが（local matchingさえあればglobal matchingはいらない、もしくはglobal matchingはlocal matchingの結果をglobalに眺めたものに過ぎない）。
また、すでにmmmmさんが6/22のコメント欄で指摘していますが、電気生理でtauを決め打ちしている点には問題があります。個々のまたはpopulationのニューロンのtauと行動のtauとが必ずしも一致している必要はないのですから。じっさい、この問題は以前にMTでのperceptual decision研究のときにも繰り返された問題でして、いろんな感度を持っているニューロンがあって、それらをどう統合して行動に結び付けているのか、という話になるのです。
(2) matchingよりももっと簡便な説明変数があるのではないか。絶対に検討しなければならないことは、今回の「matchingに関連したvalueのneural correlate」という言い方以外のもっとより簡便(parisimonious)な説明はないか、ということです。たとえば、attentionだけで説明できないか、ただのmatchingとは独立なdecisionの確信度みたいなものでは説明できないでしょうか。Control taskとmatching taskとでの違いとは、両者を比べるmatchingをしているかいないか、というよりはFig.4では二つのターゲットからのselectionをしているが、Fig.3のcontrol taskではselectionをしていない、という違いではないでしょうか。とくに、control taskではlocal incomeの違いはサッケードするターゲットを選択するのに役に立ちませんが、Fig.4のmatching taskではlocal incomeの違いがサッケードするターゲットを選択するのにcriticalな情報となっています。つまり私はこの論文で見つかったことの本質は、LIPニューロンはただ単にlocal incomeの比率のような量をコードしているのではなくて、これがdecision makingに関わるときにのみdecision variableとしてその情報がLIPで処理されている、このことだけではないかと考えるのです。そう考えてみるとやっぱりPlatt and Glimcherとの違いがいったいどの程度あるのか、という問題になります。また、Jeff SchallがFEFでさかんに研究したような複数のターゲットからのselection、というパラダイムと結び付けて考える価値があるような気がしてきました。
(2)についてまた違った言い方にしてみましょう。Matching lawは二つの間での選択だけではなくて、ある一つの行動をするかしないかという選択にも応用できます。ということは、Fig.3にあるようなコントロールタスクでもそういうmatching lawが効いているということになります。また、このコントロールタスクはターゲットが一つしかないVI強化スケジュールをやっていることになります。つまり、Fig.4のマッチングタスクとFig.3のコントロールタスクとの間でのcriticalな違いとは、どっちのターゲットを選ぶかのdecisionが要るか要らないか、という点です。この点において、Fig.3とFig.4との違いからPlatt and Glimcher論文とNewsome論文との比較をすると、decisionをするときにreward関連の情報があるとそれを加味したようなrepresentationをLIPがするという意味では両者は同じです。Fig.3のような結果に関してもPlatt and Glimcher論文でも同様なコントロール実験を持ってくればよいだけで、わざわざmatching lawを満たすような実験にする必要性はここまでではありません。よって、もうひとつ「Fig.4のマッチングタスクとFig.3のコントロールタスクとの間でのcriticalな違い」を持ってくる必要がありますが、それは上記の選択をしているか否かを選択行動理論的にパラフレーズすれば、並列強化スケジュールであるか単一強化スケジュールであるか、二つの選択でのmatching lawと行動するかしないかのmatching lawとの違い、ということになるでしょう。

■ Science Newsome論文つづき

Newsome論文の売りとしてmatching lawをlocalな時間で満たすようにexponentialで積分したfractional incomeの概念がありますが、「メイザーの学習と行動」を見ていると、localなところで最大化する理論として"momentary maximization theory"というのを説明しています。これの最大化をmatchingに変えればまんま同じです。しかもexponentialと同じような図式が図14−7にでてきます。これは面白い。ちょっとmodifyして自作してみました。大学生が要るとして、横軸は時間、縦軸は価値。試験勉強する価値は学期の始まりはほとんどゼロで、そこからexponentialに上がっていって、試験日にMAXになる。試験勉強せずにさっさと寝る価値は毎週日曜日の夜からだんだん上がっていって月曜日の朝にMAXになる。んで、月曜日の朝にはさっさと寝る価値の方が高くなるのですね。こりゃ納得。 別件。"Brain Waves: Neuroeconomists Match Valuation and Behavior in the Brain"にNewsome論文への言及があります。これからは"neuroeconomics"(神経経済学とでも訳しましょう)が来る、みたいなことしか書いていないんでどうでもよいのだけれど、関連するエントリに

• "Brain Waves: Economics from the Neurons Up"
• "Brain Waves: The Neurobiology of Trust"

があり、Glimcherがみずから"neuroeconomy"と題した本を出していることを知りました("Decisions, Uncertainty, and the Brain: The Science of Neuroeconomics." 、ついでに"Glimcher Review")。まあ、この間のVernon SmithとDaniel Kahnemanのノーベル経済学賞で心理学と経済学の組み合わせが脚光を浴びたから次は神経科学と経済学というわけですな。しかしこりゃあもう陣地は取られているような感じですな。なんかもっと違うことを考えなくては。 追記：mmmmさん、ありがとうございます。コメントではリンクできないようです。こちらでリンクしておきます。

• Cardinal et al. (2001) "Impulsive choice induced in rats by lesions of the nucleus accumbens core."

そういう意味ではラットでたくさんありそうですね。

■ あーすばらしい。

Newsome論文スレッドはうまいこと伸びましたね。mmmmさん、mmrlさんのおかげです。大感謝。こういうふうにうまくいくスレッドがもっと増えて並行して複数流れるようになって、究極にはべつに私がいなくても参加者のあいだでやり取りが始まっている、というふうにメディア化してゆく、というのがいいなあと思います。1/17に書いた「2ちゃんねる形式で論文ごとにスレを立ててそれぞれにコメントを付けるという風にして、ゆくゆくは私以外もスレを立てられるようにする」と基本的には同じことですが、もう少しイメージが現実味を帯びてきました。あのとき書いた「匿名性」とはいま書いた「メディア化してゆく」ということだったんだと思う。あんまそっちばっかでも疲れるけど。追記：これってようするにスラッシュドットと同じだろうか。あれよくわかんないんですよ。

■ JNS 6/30

"Double Dissociation between the Effects of Peri-Postrhinal Cortex and Hippocampal Lesions on Tests of Object Recognition and Spatial Memory: Heterogeneity of Function within the Temporal Lobe." Timothy J. Bussey以前からrecognition memoryをラットで研究することあたりの話をしましたが、これも関係しそうです。Perirhinalのlesionとhippocampusのlesionとで機能のdouble dissociationがあることについてはMishkinの時代からAmaralやらGaffanやMurrayなどがさかんにやってきているわけですが、それをratの系に持ってきた、ということのようです。これはもちろんラットでやることのメリットがいろいろあるわけでして(ほんとうはマウスの方がもっとよいでしょうけど)、可能であるならより単純な系でanalogousなものを見れるようにしたい、という意味で評価できると思います。内容は読んでないけど、perirhinalがobject recognition、hippocampusがspatial memory、というのはあたりまえのようだが重要です。こんどはBuckley,Gaffan and MurrayのJNP '97 "Functional double dissociation between two inferior temporal cortical areas: perirhinal cortex versus middle temporal gyrus."を再現するようなITとperirhinalの比較に向かったら面白いじゃないでしょうか。Perirhinalはただのobject recognitionじゃないだろうし。

■ Nature 7/1

"Local sleep and learning."
NVもあるけど、ちょうどALLAN HOBSONがエッセイを書いている。
"A model for madness?" ALLAN HOBSON

■ Science Newsome論文つづき

"Matching Behavior and the Representation of Value in the Parietal Cortex." Leo P. Sugrue, Greg S. Corrado, William T. Newsome

mmrlさんから6/29のコメントにあるbayesian harvestingに関する詳しい解説と図が届きました。どうもありがとうございます。以下に掲載します。今日はmmrlさんによるゲストブログみたいなもんですので、＜blockquote＞に入れないで地の文に入れます。貼り付けてある図は図２の方です。図１は6/30のところに貼ってあります。はてなは一日一枚しか画像が貼れないもんで。なぜか図が小さくなってしまったので6/29にもっと大きい図２を貼っておきました。そちらをご参照ください。 (追記：はてなからの移行の際に図の配置を直しました。図1、図2ともに下に貼りました。)

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mmrlです

先日説明したbayesian harvestingですが、図をはさんでいただけるということですので、ちょっと計算をしてみました。Corrado のポスターの式を参考にしました。すでにpooneilさんがやさしい言葉で説明されているVI-VIの場合に最適行動はmatching にほぼ等しくなることを式で書いただけというだけです。少々長くなりますが、私のような式や実際に動くプログラムやロボットで納得する人間のエゴとお許しください。

離散時間で進行するVI-VI平行スケジュールはある確率で報酬が出現し、取るまでそのままという形で実現できます。毎回red/greenに報酬が出現する確率をp_red/p_green とすると、greenに報酬が存在する確率P(r_green)は前回greenをためした回からの回数をkとしてP(r_green)_k = 1-(1-p_green)^k となります.

なぜなら,
１回では
       p_green,
２回では最初の１回で出現する確率＋１回目で出現せず２回目で出現する確率＝
       p_green + p_green(1-p_green),
3回目では
       p_green + p_green(1-p_green) + p_green(1-p_green)^2
となり
k回目では
       p_green (1 + (1-p_green) + (1-p_green)^2 + ... + (1-p_green)^(k-1))
となり等比級数公式から
       P(r_green)_k = p_green(1-(1-p_green)^k)/(1-(1-p_green)) = 1-(1-p_green)^k
red を選び続ければ、p_greenがどんなに小さくてもP(r_green)_kは1に漸近しますから、
ほぼ100%でgreenに報酬があることになります。

ここで、baysian harvestingとは、報酬の存在確率を初回をP(r_red) = 0 , P(r_green) = 0 として上の式にしたがって計算し、その回(t)におけるP(r_red)(t) > P(r_green)(t)ならredを逆ならgreenを選ぶ最適選択者とします。とすると図１にあるようにredが上回ればredを選択し、確率0にリセット、green が上回れば..という周期パターンで行動を選択することになります。

ここで、p_red > p_green の場合に限定して考えると、redを選ぶ回数n_red(>=1)回に１回green を選ぶパターンになるはずです。（図１では３回に１回p_red = 1/3, p_green = 1/10）

したがって選択の割合はn_red:1となり、このときn_redは log(1-p_red)/log(1-p_green) の小数点きりすて整数になります。

  なぜなら,n_red回はredを選ぶので報酬存在確率は
 　  p_red > 1-(1-p_green)^n_red
　次の回でこの関係が逆転するので、
    p_red < 1-(1-p_green)^(n_red+1)
  これを変形して    (1-p_green)^(n_red+1) < (1-p_red)
 　の両辺をlog取って変形すると
    n_red > log(1-p_red)/log(1-p_green) -1
　となる最小整数がn_redであるから、
　  n_red = floor[log(1-p_red)/log(1-p_green) ]
   ここでfloor[x]はx以下の最大整数

これで得られるn_redを使って選択割合、n_red/(1+n_red)を報酬割合p_red/(p_green + p_red)の関数としてプロットすると図２のようになります。(p_red + p_green = 1/3の制約を与えています）。matching は、選択割合と報酬割合が一致するのですから傾き１の直線になります。ごらんのような階段関数となりますが、n_redが増えるにしたがって接近しているのがお分かりいただけるかと思います。ただこれが完全に一致するかというとどうかわからないところです。細かいところまでみると、どうも完全に一致しないように思います。

---

mmrlさん、どうもありがとうございました。すごい。

ひとつコメントですが、図２ってスムージングをかけてやると、逆S字型のカーブになりますが、それってgeneralized matching lawでいうところの過小な適応(強化の比率ほどには選択の比率が0.5からズレない)の形に近似できる感じがします（スムージングをしてから両座標をlogスケールにすると傾きが<1になる）。Bayesian harvestingによってやや過小ぎみな適応をしている、ということになるとじつはこっちの方がFig.1にある青線と黒線のずれをよく説明できるような気もしてきます。（あ、過小じゃなくて過大だったかも。）

そういえばVI-VI並列強化スケジュールとVR-VR並列強化スケジュールに関しては"高橋雅治(1997) 選択行動の研究における最近の展開：比較意思決定研究にむけて"に記載がありました。VI-VR並列ではVIのほうがより多く選択されることや遅延低減仮説に関して書かれています。やっぱりこのへんまだいろいろありそうです。

お勧めエントリ

• 細胞外電極はなにを見ているか(1) 20080727 (2) リニューアル版 20081107
• 総説 長期記憶の脳内メカニズム 20100909
• 駒場講義2013 「意識の科学的研究 - 盲視を起点に」20130626
• 駒場講義2012レジメ 意識と注意の脳内メカニズム(1) 注意 20121010 (2) 意識 20121011
• 視覚、注意、言語で3*2の背側、腹側経路説 20140119
• 脳科学辞典の項目書いた 「盲視」 20130407
• 脳科学辞典の項目書いた 「気づき」 20130228
• 脳科学辞典の項目書いた 「サリエンシー」 20121224
• 脳科学辞典の項目書いた 「マイクロサッケード」 20121227
• 盲視でおこる「なにかあるかんじ」 20110126
• DKL色空間についてまとめ 20090113
• 科学基礎論学会 秋の研究例会 ワークショップ「意識の神経科学と神経現象学」レジメ 20131102
• ギャラガー＆ザハヴィ『現象学的な心』合評会レジメ 20130628
• Marrのrepresentationとprocessをベイトソン流に解釈する (1) 20100317 (2) 20100317
• 半側空間無視と同名半盲とは区別できるか？(1) 20080220 (2) 半側空間無視の原因部位は？ 20080221
• MarrのVisionの最初と最後だけを読む 20071213

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