pooneilの脳科学論文コメント

■ homonymous hemianopia

Blindsightのpatient studyというのは初期はほとんどDBさんだし、ここ10年くらいのものはほとんどがGYさんを被験者としたものです。もちろんこのような現象が見られるのはこの二人に限ったことではないのですが、実際のところどのくらいの頻度で起こる現象なのか、というのが気になります。とくに、同名半盲homonymous hemianopiaの患者さんのうちでどのくらいの割合で見られるものなのか、というようなstudyはわたしが知る限りではありません。ようするに、hemineglectの場合で言えば"The Anatomy of Spatial Neglect based on Voxelwise Statistical Analysis: A Study of 140 Patients" Hans-Otto Karnath et alとかに相当するようなものがないのです。
んでさいきん見つけたのが子どもでの症例に関するこれ、
Dev Med Child Neurol. 2005 Oct;47(10):699-702. "Blindsight in children: does it exist and can it be used to help the child? Observations on a case series."
です。この雑誌を購読してないので論文は入手できなくて母集団がよくわからなかったのですが、hemianopiaなのは4人で、しかもそこで示されているblindsightの証拠はあくまで"evidence of perception of movement in the blind visual field"であって、stationaryなものに対するものではありません。つまり、RiddochによるBrain 1917とかで描写されているものと同様なものであって、DBさんやGYさんが示すようないわゆるblindsightではありません。というわけで、けっきょくのところわからずじまい。
というわけで、だれかメタアナリシスでもやれば、それだけでも価値ある論文になるのではないでしょうか。もしくは、上記のHans-Otto Karnath論文ででも、neglectのない純粋なhemianopiaの症例を解析しているわけでして……と考えるとなかなか難しい問題がありそうな予感も。じっさい、hemianopiaの症例の論文を読んでても、blindsightに関する記述がないものなんてざらだし、というかどうやら存在を認めていないようすもうかがえるし。

■ Amputator 1.2入れました

Movable type関連。PubMed RSSを入れるようになってからW3CのXHTML validatorでinvalidになったままでした。これは、PubMed RSSで送られてくる論文のURLには&が含まれているためです。CGIへ変数を渡すときに&を使うのだけれど、これは＆amp;というふうに文字実体参照を入力してやらないといけないわけです。

というわけでAmputator 1.2プラグインを入れました。これで20050919のコードを

<$MTGetXMLValue name="link"$>

から

<$MTGetXMLValue name="link" encode_ampersands="1"$>

へ、ついでに

<$MTEntryBody$>

から

<$MTEntryBody encode_ampersands="1"$>

へ直すことによって、&問題を解消しました。めんどくさい。

■ さいきんのNature

しばらくNature読んでなかったので、見逃してる論文がないかチェックしてたんだけれど、うーむ、これはやっぱりかなりキビしいことになってるんではないでしょうか。今年出たNatureでのnhpの論文はLogothetisのretinal lesionとEarl Millerのstriatumからcortexへの流れと下記の聴覚野ピッチニューロンだけ？ 20040617や20040618のエントリなど見ていただければ流れがもっとよくわかるかと思います。

• 8/25 "The neuronal representation of pitch in primate auditory cortex"
• 9/15 "A sensory source for motor variation"
• 9/22 "A role for lateral hypothalamic orexin neurons in reward seeking"
• 10/13 "Repeated cocaine exposure in vivo facilitates LTP induction in midbrain dopamine neurons"
• 10/20 "Activity of striatal neurons reflects dynamic encoding and recoding of procedural memories" Ann M. Graybiel

■ 論文いろいろ

JNS 10/12

• "Neuronal Basis of Covert Spatial Attention in the Frontal Eye Field" 読まなくちゃいけないんだけれど、このへんぜんぜん追いつけてない。焦る。

JNS 10/19

• "Visual Selection and Posterior Parietal Cortex: Effects of Repetitive Transcranial Magnetic Stimulation on Partial Report Analyzed by Bundesen's Theory of Visual Attention" Jon Driver and Vincent WalshでPPCにTMS。Bundesenのformal analysisというやつが重要そう。

Neuron 10/20

• "Neural Correlates of Knowledge: Stable Representation of Stimulus Associations across Variations in Behavioral Performance" Larry R. SquireとかSan Diegoのひとたち。ファーストのAdam MessingerはPNASにpair codingの形成過程の論文を書いてからSteven P. Wiseのところへ行ったと聞いていたのだけれど、戻ったのか、昔の仕事が出たということか。

■ JNP 11月号

• "Laminar Variation in Threshold for Detection of Electrical Excitation of Striate Cortex by Macaques" Edgar A. DeYoe, Jeffrey D. Lewine and Robert W. Doty
• "Psychophysics of Electrical Stimulation of Striate Cortex in Macaques" John R. Bartlett, Edgar A. DeYoe, Robert W. Doty, Barry B. Lee, Jeffrey D. Lewine, Nubio Negrão and William H. Overman, Jr V1へのmicrostimulationによるphosphoneに関する論文2連発。"Preliminary communications of these data have been presented (Bartlett et al. 1977; Lee et al. 1973)." なんて恐ろしいことが書いてある。30年ですよ！ Tehovnikの論文とか、さいきんの流れであることを認識したのでしょうか？
• "Low-Frequency Oscillations Arising From Competitive Interactions Between Visual Stimuli in Macaque Inferotemporal Cortex" この発火パターンには見覚えがあって、なんか意味はあるのだと思います。菅生さんのNature '99とかでの早い部分の発火と遅い部分の発火でのコーディングの違いとか、Richmond and OpticanのITニューロンでの一連の仕事とか、そのへんはみんなたぶんこの問題と関連しているわけで。
• "Dynamic Circuitry for Updating Spatial Representations. I. Behavioral Evidence for Interhemispheric Transfer in the Split-Brain Macaque"
• "Dynamic Circuitry for Updating Spatial Representations. II. Physiological Evidence for Interhemispheric Transfer in Area LIP of the Split-Brain Macaque" Carol L. Colbyによる連報。JNPはあいかわらず連報が多いですね。JNSとかはそういうのはdiscourageさせる、とか書いてあった気がする。Split-Brainを使ってInterhemispheric Transferの議論をしてる。要旨にも書いてあるけど、split-brainにすればinterhemisphericなremappingは起こらないだろう、と予想して実験を始めたんだけれどそうでもなかったんで、なんとか議論して論文にした、というかんじなんだと思います。Tomita et al Nature '99では複雑なshapeを使うことでsubcorticalなtransferがあり得ないだろう、ということをよりどころにしていたのに対して、今回のようなパラダイムではsubcorticalな領域、pulvinarなどのthalamusやbasal gangliaの影響をまったく取り除くことができない。そのへんに問題があったのではないかと読まずにコメント(読んだ人がつっこんでほしい)。

■ ここさいきんで買って読んだ本

行動分析学入門 集英社新書 杉山 尚子 図式を頭にたたき込むのには、わかりやすいのでよかったです。
飛鳥井全死は間違えない 元長 柾木 メタテキスト云々とか、ラストの盛り上がりとか、なかなか良かったけど、もっとシビレさせてほしかった。コズミック・ランが流れてくるみたいなかんじで。

■ 「ぼくらの小松崎茂展」

刈谷の美術館で「ぼくらの小松崎茂展」というのをやっていたので先週末行ってきました。わたしの世代にとってはタミヤのプラモデルの箱絵の人ですが、戦後の絵物語、少年マガジンとかの口絵、円谷映画、サンダーバード、このへんの流れが全部わかる展示でした。子どもたちも大喜び、SFっぽいやつがおもしろかったようで、1960年代に2000年の未来予想として書かれたのだ、という点なども楽しんでもらえたようす。
なにげに脳波から考えを読まれて管理化が厳しくなる、なんて未来予測の記事に挿絵を付けていたりして、つい読みふけってしまったり。昔から言われていたことがげんざいneuroal prosthesisとして形作られてきたってことっすね。
おみやげにタミヤのプラモとかが売ってたらよかったのだけれどなかった。しかたなく一種類しかなかった500ピースのジグソーパズルを買って作ってます。半分くらい完成……てめちゃ忙しいときにこういうことをやるのは逃避です、ハウルの城のぺーパークラフトも放置中だし、どうしよう。

■ 論文メモ 混乱編

新事実判明とか、一般公開とか、ソフトボール大会とか、科研費とか、SFN準備とかで超余裕ない。訳もわからずメモ作成。だれか私とディスカッションしてください。

• Brain Res. 1991 May 24;549(2):222-9. "The striatum and motor cortex in motor initiation and execution"
• The Journal of Neuroscience, April 1, 2000, 20(7):2691-2700 "What and When: Parallel and Convergent Processing in Motor Control"
• Brain, Vol. 124, No. 3, 558-570, March 2001 "Event-related functional magnetic resonance imaging in Parkinson's disease before and after levodopa"
• The Journal of Neurophysiology Vol. 86 No. 3 September 2001, pp. 1195-1201 "Time Course of Determination of Movement Direction in the Reaction Time Task in Humans"
• Brain, Vol. 124, No. 10, 2045-2058, October 2001 "Control of volitional and reflexive saccades in Tourette's syndrome"
• Experimental Brain Research "The timing and intensity of transcranial magnetic stimulation, and the scalp site stimulated, as variables influencing motor sequence performance in healthy subjects"
• Exp Brain Res. 1992;91(3):363-84. "Role of primate basal ganglia and frontal cortex in the internal generation of movements. I. Preparatory activity in the anterior striatum"

■ 髄膜炎

昔のブックマークを整理してリスト化シリーズ。

• IDWR: 感染症の話　髄膜炎菌性髄膜炎
• 化膿性髄膜炎について
• 細菌性髄膜炎（化膿性髄膜炎）
• 熱帯医学データベース
• 化膿性髄膜炎患児の看護
• 無菌性髄膜炎
• 細菌性髄膜炎,化膿性髄膜炎
• 脳炎・脊髄炎・髄膜炎
• 髄膜炎
• 【髄膜炎(ずいまくえん）】

■ 論文いろいろ

PNAS 9/27
Imaging input and output of neocortical networks in vivo スライスにoregon greenをロードしてるんだけど、グリアにも入っている様子。細胞体の部分のCaシグナルからスパイク数(ニューロンの出力)をある程度予測できるというのはいいのだけれど、neuropilの部分のCaシグナル(グリアとかのCaを反映)をニューロンへの入力として扱うのはかなり無理がありそう。もちろん、入力と出力とを分けて解析できたら局所回路の解析におけるメリットは多大なわけだけど。そういうわけでガヤ論文とも関係してる。Max Planckなので、Sakmannがcommunicateしてる。
Nature Neuroscience 10月号
Timing of the brain events underlying access to consciousness during the attentional blink Stanislas Dehaene。この前言及したNature Neuroscience Reviewでは見えたか見えないかの二分法が批判されていたけど、今回も変わらず、というかんじ。
NVがTwo-timing attentionにあり。
Cortical responses to invisible objects in the human dorsal and ventral pathways Sheng He。GoodaleがF1000で持ち上げてたやつ。
NVがObject-specific unconscious processingにあり。
Inferring another's expectation from action: the role of peripheral sensation
fMRI evidence for the neural representation of faces

■ ラーメン談義revisited

名古屋へ出かけたので、周辺のラーメン屋を巡ってみることにしました。ラーオタモード。塩系をメインに。
金山から上前津で乗り換えて鶴舞線で荒畑で降りて、ラーメン三吉へ。(前にも書いた「たかみ」の跡地です。) 開店ぎりぎり。私以外の客はもう一人ラーオタっぽい人。牡蠣のクラムチャウダー塩ラーメン、というのを前日から始めているのを知ってこれを食べました。クリーミーで魚介のフレーバーということでラーメンには合うだろうと予想しましたが、なかなか良かったです。
んで荒畑からまた鶴舞線に乗っていりなか駅で降りて翠蓮へ。テレビで紹介されるようなところらしいので覚悟して行ったけどべつに並んでませんでした。客には地元の大学生(南山大？)も多く、女性も入れるきれいなラーメン屋さん。小さい塩ラーメンとチャーシュー丼を。エビの香りがするスープとやらかいチャーシューでうまかったです。そういうわけで、チャーシュー丼も選んで正解。でもさすがに昼に二店行くのは苦しかった。
本山から池下まで地下鉄に乗って、慈庵へ。ここがwebで見ていると不定期営業でなかなか入れないらしいのだけど、開いてました。初チャレンジで成功。先客二人。それぞれ単独の客で、私が入った後にも一人客が入ってきて、客が私を含めて全員ラーオタだけという状態に。地元の人がふらりと来るようなところではなくて、私を含めてみんなwebで調べてはるばるやってくるわけですな。たしかに塩ラーメンはうまかったです。
もう一店行くつもりだったけど、力尽きてその日は終わりました。

■ 共感覚

「共感覚える」と書いてあって、「共感覚」のことかと読み違えた。「この先生きのこる」みたいなもん。
とかいうどうでもいいねたを書くことがめっきり減ったのははてなを離れたからで、なんかちょっとしたメモには使いにくいんですよ。
Movable type 3.2はとりあえずローカルにインストールしてみて使い勝手など調べてから移行する予定です。バグとかもあるようだし、3.21くらいになって安定してからの方がよいかも。

■ susceptibility artifact

以前チタンによるMR Imagingでのsusceptibility artifactにかんして調べたことがあって、そのときのブックマークが出てきたのでそれをリスト化しておきます。(ネタに詰まったので昔のブックマークを整理している、というわけです。)

• American Journal of Roentgenology, Vol 171, 1207-1213 Minimizing artifacts caused by metallic implants at MR imaging: experimental and clinical studies
• J Dent Res 82(8): 602-606, 2003 Artifacts from Dental Casting Alloys in Magnetic Resonance Imaging
• J Neurosurg. 2002 Dec;97(6):1472-5. Quantification of susceptibility artifacts produced on high-field magnetic resonance images by various biomaterials used for neurosurgical implants. Technical note.
• Can MRI be done on patient with implanted cerebral titanium clips.
• Magnetic Resonance Imaging of Periarticular Titanium Screws: The Relationship of Screw Position to the Ability to Image Articular Cartilage
• Magnetic resonance imaging guided musculoskeletal interventions at 0.23T
• MR parameters for imaging titanium spinal instrumentation
• Relation Between Magnetic Susceptibility of Non-ferromagnetic Dental Alloys and Metal Artifacts in Magnetic Resonance Imaging (MRI)
• Anterior Cervical Spine Fixation: Material Technology
• Pedicle Screw Segmental Instrumentation
• ご隠居の推薦を追記：The role of magnetic susceptibility in magnetic resonance imaging: MRI magnetic compatibility of the first and second kinds

お勧めエントリ

• 細胞外電極はなにを見ているか(1) 20080727 (2) リニューアル版 20081107
• 総説 長期記憶の脳内メカニズム 20100909
• 駒場講義2013 「意識の科学的研究 - 盲視を起点に」20130626
• 駒場講義2012レジメ 意識と注意の脳内メカニズム(1) 注意 20121010 (2) 意識 20121011
• 視覚、注意、言語で3*2の背側、腹側経路説 20140119
• 脳科学辞典の項目書いた 「盲視」 20130407
• 脳科学辞典の項目書いた 「気づき」 20130228
• 脳科学辞典の項目書いた 「サリエンシー」 20121224
• 脳科学辞典の項目書いた 「マイクロサッケード」 20121227
• 盲視でおこる「なにかあるかんじ」 20110126
• DKL色空間についてまとめ 20090113
• 科学基礎論学会 秋の研究例会 ワークショップ「意識の神経科学と神経現象学」レジメ 20131102
• ギャラガー＆ザハヴィ『現象学的な心』合評会レジメ 20130628
• Marrのrepresentationとprocessをベイトソン流に解釈する (1) 20100317 (2) 20100317
• 半側空間無視と同名半盲とは区別できるか？(1) 20080220 (2) 半側空間無視の原因部位は？ 20080221
• MarrのVisionの最初と最後だけを読む 20071213

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